Fabien Campillo ; Mohsen Chebbi ; Salwa Toumi - Stochastic modeling for biotechnologies Anaerobic model AM2b

arima:3159 - Revue Africaine de Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées, June 10, 2019, Volume 28 - 2018 - 2019 - Mathematics for Biology and the Environment - https://doi.org/10.46298/arima.3159
Stochastic modeling for biotechnologies Anaerobic model AM2bArticle

Authors: Fabien Campillo ORCID1; Mohsen Chebbi 2,3; Salwa Toumi 4,5

[en]
Le modèle AM2b est classiquement représenté par un système d'équations différentielles. Toutefois ce modèle n'est valide qu'en grande population et notre objectif est d'établir plusieurs mo-dèles stochastiques à différentes échelles. À l'échelle microscopique, on propose un modèle sto-chastique de saut pur que l'on peut simuler de fa con exacte. Mais dans la plupart des situations ce genre de simulation n'est pas réaliste, et nous proposons des méthodes de simulation approchées de type poissonnien ou de type diffusif. La méthode de simulation de type diffusif peut être vue comme une discrétisation d'une équation différentielle stochastique. Nous présentons enfin de fa con infor-melle un résultat de type loi des grands nombres/théorème central limite fonctionnelle qui démontre la convergence de ses modèles stochastiques vers le modèles déterministe initial.

[fr]
The model AM2b is conventionally represented by a system of differential equations. However, this model is valid only in a large population context and our objective is to establish several stochastic models at different scales. At a microscopic scale, we propose a pure jump stochastic model that can be simulated exactly. But in most situations this exact simulation is not feasible, and we propose approximate simulation methods of Poisson type and of diffusive type. The diffusive type simulation method can be seen as a discretization of a stochastic differential equation. Finally, we formally present a result of law of large numbers and of functional central limit theorem which demonstrates the convergence of these stochastic models towards the initial deterministic models.


Volume: Volume 28 - 2018 - 2019 - Mathematics for Biology and the Environment
Published on: June 10, 2019
Accepted on: January 23, 2019
Submitted on: February 24, 2017
Keywords: [MATH]Mathematics [math], [SDV]Life Sciences [q-bio], [CHIM]Chemical Sciences, [en] stochastic differential equation, AM2b model, ordinary differential equation, pure jump process, diffusion approximation; [fr] équation différentielle ordinaire, modèle AM2b, processus de saut pur, approximation diffusion, équation différentielle stochastique

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